Pada 1 Mei 2003, pentadbiran Sekolah Menengah Kebangsaan Penanti telah diambil alih oleh Tuan Haji Mohd Daud bin Hasanudin. Sekolah Menengah Kebangsaan Penanti mencatat beberapa lagi kejayaan di bawah pentadbiran beliau. Untuk lima tahun berturut-turut, asrama Sekolah Menengah Kebangsaan Penanti dianugerah Asrama Lima Mutiara. Sekolah ini juga telah dicalonkan untuk mendapat anugerah Sekolah Harapan Negara 2003. Buat pertama kalinya, seorang pelajar Tingkatan Enam Sekolah Menengah Kebangsaan Penanti telah berjaya mendapat 5A dalam peperiksaan Sijil Tinggi Persekolahan Malaysia. Cik Norasmahani bt Hussain menjadi pelajar Melayu tunggal antara 14 pelajar lain di negeri ini yang memperolehi keputusan 5A dalam peperiksaan Sijil Tinggi Persekolahan Malaysia (STPM) tahun 2003.

Pada 23 Februari 2013 , skuad ragbi Sekolah Menengah Kebangsaan Penanti (MOHAMAD ROSLAINI BIN ABDUL RAZAK sEbagai jurulatih dan pengurus pasukan) buat julung kalinya menjuarai KEJOHANAN RAGBI MSSPP BAWAH 18 TAHUN 15 SEPASUKAN (divesyen 2) dengan menewaskan SEKOLAH MENENGAH SAINS KEPALA BATAS dengan skor 15 berbalas 14. SMK Penanti merupakan satu-satunya sekolah berstatuskan SMK yang berjaya melepasi suku akhir serta separuh akhir untuk melayakkan diri ke perlawanan akhir (divisyen 2) pada tahun tersebut. Antara pasukan dari sekolah lain yang juga bermain di dalam divesyen 2 ialah KV BUTTERWORTH dan KV SEBERANG PERAI.

Kelab usahawan muda juga merupakan antara faktor SMK PENANTI di kenali di seluruh PULAU PINANG malah di peringkat kebangsaan.Selama 3 tahun berturut SMK PENANTI menjadi JOHAN keseluruhan dalam pertandingan usahawan muda peringkat negeri.